| ACCUEIL ET SOLEIL | Foyers socio-éducatifs |
| ASSOCIATION COMMUNALE DE CHASSE AGREEE DE MESNAY | Chasse |
| ASSOCIATION DES AMIS DE LA MAISON DE VACANCES FAMILIALES DE LA BISE | Associations caritatives, humanitaires, aide au développement, développement du bénévolat |
| AU JARDIN DE LA MUSIQUE | Chant choral, musique |
| CA CARTON' | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| CERCLE D'ANIMATION ET DE LOISIRS DE MESNAY | Activités de plein air (dont saut à l'élastique) |
| CHANTEVIGNE | Clubs de loisirs, relations |
| CLUB D'ESCALADE DU CANTON D'ARBOIS | Sports de neige (ski alpin, ski de fond, snowboard) sports de montagne |
| COLLECTIF G.R.A.O.U. THEATRE | Promotion de l'art et des artistes |
| COMPAGNIE SEMAPHORE | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| DECLIC | Associations caritatives, humanitaires, aide au développement, développement du bénévolat |
| GRAINE DE PARENTS | Aide et conseils aux familles |
| IDÉEHAUT | Actions de sensibilisation et d'éducation à l'environnement et au développement durable |
| KIOSK THÉÂTRE | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| LA CARTONNERIE DE MESNAY | Musées, collections historiques |
| LA COMPAGNIE ALLONS'Z'ENFANTS | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| LA MAISON DU DIRECTEUR | Photographie, cinéma (dont ciné-clubs) |
| LE DEROCHOIR | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| LE GAZOUILLIS DES ÉLÉPHANTS | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |
| LE QUEUTCHET | Défense et amélioration du cadre de vie |
| LES COMPAGNONS DU MIEL | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| LES RABADJOS | Sports, activités de plein air |
| MESNAY APIS ET FLORE | Recherche sur l'environnement et le climat |
| MUSEE DE L'ABEILLE RAYMOND BORNECK | Associations d'exploitants agricoles, élevage, horticulture, aviculture, apiculture, viticulture, viniculture |
| OFFICE DU TOURISME D'ARBOIS, VIGNES ET VILLAGET - PAYS DE LOUIS PASTEUR | |
| PLAY-MOBILES | Chant choral, musique |
| PRESENCE ET ACTION DU GAULLISME DE FRANCHE COMTE | Associations à caractère politique général |
| PROJET D | Promotion de l'art et des artistes |
| PUDDING THEATRE | Théâtre, marionnettes, cirque, spectacles de variété |