| "ATSATI" AMICALE DES TECHNICIENS SUPERIEURS - ASSISTANCE TECHNIQUE D'INGENIEUR | Organisation de professions (hors caractère syndical) |
| 4L TROPHY ITII AUXERRE | Associations caritatives, humanitaires, aide au développement, développement du bénévolat |
| A TIRE D'AILE | Préservation du patrimoine |
| ACADÉMIE DE MUSIQUE ANCIENNE DE TONNERRE | Chant choral, musique |
| ACTIV'UNA TONNERROIS | Aide à domicile |
| AMICALE D'ACTION SOCIALE DES AGENTS COMMUNAUX DE TONNERRE | Organisation de professions (hors caractère syndical) |
| AMICALE DES SAPEURS POMPIERS DE TONNERRE | Amicales, groupements affinitaires, groupements d'entraide (hors défense de droits fondamentaux) |
| AMIS ET PARENTS D'ELEVES DU CONSERVATOIRE DE TONNERRE | éducation formation |
| ART SCENE | Chant choral, musique |
| ASSOCIATION CULTUELLE MAROCAINE TONNERROISE | |
| ASSOCIATION D'AIDE À LA SCOLARISATION DES MEDRASSA DE MERNISSA | Associations périscolaires, coopération scolaire, aide à l'enseignement |
| ASSOCIATION DE PRÉSERVATION ET DE SOUTIEN DU MUSÉE DE LA RDA | Préservation du patrimoine |
| ASSOCIATION DE SOUTIEN A L'E2C YONNE | éducation formation |
| ASSOCIATION DES CHASSEURS DU BOIS DE LA VILLE | Chasse |
| ASSOCIATION DES ENTREPRENEURS DU TONNERROIS | Représentation, promotion et défense d'intérêts économiques |
| ASSOCIATION DES JEUNES DU TONNERROIS | Maisons de jeunes, foyers, clubs de jeunes |
| ASSOCIATION DES JEUNES SAPEURS-POMPIERS DE TONNERRE | Amicales, groupements affinitaires, groupements d'entraide (hors défense de droits fondamentaux) |
| ASSOCIATION DES MEDECINS URGENTISTES DE TONNERRE | éducation formation |
| ASSOCIATION DES RETRAITES HOSPITALIERS DE TONNERRE | Association du personnel d'une entreprise (hors caractère syndical) |
| ASSOCIATION GROUPE RÉFLEXION, ÉTUDE ET PROPOSITIONS POUR LA NOBLESSE "REP" | échanges locaux, réseaux d'échanges |
| ASSOCIATION ICAUNAISE DE CONSEIL ET D'ENTRAIDE DES ETABLISSEMENTS SOCIAUX | Foyers socio-éducatifs |
| ASSOCIATION MISSION LOCALE RURALE TONNEROIS -AVALLONNAIS | Aide à l'emploi, développement local, promotion de solidarités économiques, vie locale |
| ASSOCIATION POUR L'ANIMATION DU HAMEAU DES MULOTS | Clubs de loisirs, relations |
| ASSOCIATION POUR LA SAUVEGARDE ET LA MISE EN VALEUR DU PATRIMOINE DE TONNERRE, ET LE DÉVELOPPEMENT CULTUREL ET ÉCONOMIQUE DE SON CENTRE HISTORIQUE. | Comités de défense du patrimoine |
| ASSOCIATION POUR LA VALORISATION DE TANLAY, DE SON CHÂTEAU ET DE L'ABBAYE DE QUINCY - A.V.T.A.Q. | Protection de sites naturels |
| ASSOCIATION POUR LE RAYONNEMENT DE L'ÉGLISE SAINT PIERRE DE TONNERRE (YONNE) | Préservation du patrimoine |
| ASSOCIATION ROSE DES SABLES | Activités festives (soirées.) |
| ASSOCIATION SAINT JOSEPH | Gestion financière, gestion immobilière |
| ASSOCIATION SANTÉ LE TONNERROIS EN BOURGOGNE | Santé |
| ASSOCIATION SPORTIVE DU COLLEGE ABEL MINARD | Associations multisports scolaires ou universitaires |
| ASSOCIATION SPORTIVE LYCÉE CHEVALIER D'ÉON | Associations multisports scolaires ou universitaires |
| ASSOCIATION TONNERROISE DES AMIS DE DOBRIS | Jumelages, échanges culturels, organisation d'échanges linguistiques, échanges culturels au plan international |
| ASSOCIATION UNIESVERS'ELLES | Lutte contre diverses formes de violence |
| ATELIER ARCHIPELS | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| BOURGOGNE - BELARUS | Jumelages, échanges culturels, organisation d'échanges linguistiques, échanges culturels au plan international |
| BUREAU DES ÉTUDIANTS DE CRÉASUP DIGITAL | éducation formation |
| CENTRE DE DÉVELOPPEMENT ECONOMIQUE DU TONNERROIS | Aide à l'emploi, développement local, promotion de solidarités économiques, vie locale |
| CHASSE DU BOIS RABOT | Chasse |
| CHOEUR DU TONNERROIS | Chant choral, musique |
| CLUB DE FLÉCHETTES DE TONNERRE | Clubs de loisirs, relations |
| CLUB EMILE BERNARD | Clubs troisième âge |
| CONFRERIE DES FOUDRES TONNERROIS | Artisanat, travaux manuels, bricolage, expositions |
| CONSTRUIRE AU FEMININ | Artisanat, travaux manuels, bricolage, expositions |
| COOPERATIVE SCOLAIRE DE LA S.E.G.P.A DU COLLEGE ABEL MINARD | Organisation, financement de voyages d'études, d'échanges, pour scolaires ou universitaires |
| CREE TON AIR | Action socioculturelle |
| DANSES DU TONNERRE ! | Danse |
| DE NOUS POUR VOUS | Comités des fêtes |
| ESPRIT NATURE | Défense et amélioration du cadre de vie |
| GALERIE ALFRED GREVIN | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| GIPS 89 - GROUPEMENT INTERPROFESSIONNEL DE PROXIMITE ET DE SANTE 89 | Cliniques, centres médicaux, hôpitaux, sanatoriums, établissements de rééducation, maisons de convalescence |
| HAKAMO | Artisanat, travaux manuels, bricolage, expositions |
| JARDINS DES PRÈS-HAUTS | Jardinage, jardins ouvriers, floralies |
| JISEIDO 89 | Sports, activités de plein air |
| JOURNÉES GOURMANDES ET ARTISANALES DU TONNERROIS | Gastronomie, ?nologie, confréries, gourmets |
| JUNE | Amicales, groupements affinitaires, groupements d'entraide (hors défense de droits fondamentaux) |
| KARIM MOSTA TRAILRAID ACTIONS | Associations multisports locales |
| L'ECHO DE LA FOSSE DIONNE | Action socioculturelle |
| L'ECLAIR DE CAMPENON | Activités festives (soirées.) |
| L'OEIL A MEMOIRES | Promotion de l'art et des artistes |
| LA BELLE ARMANÇON | Amicales de commerçants, organisation de foires |
| LA COMPAGNIE DE L'ARMANCON | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| LA CREALE | Chasse |
| LADY CAT ASSOCIATION | Protection des animaux |
| LE COLLECTIF DE SOUTIEN ET DE DÉFENSE DU CENTRE HOSPITALIER DU TONNERROIS | Santé |
| LE FOU D'ECHECS | Bridge, jeux de cartes, échecs, dames, jeux de société . |
| LE PHOENIX | Comités des fêtes |
| LES AMIS DE L'HOTEL DIEU DES FONTENILLES | Activités festives (soirées.) |
| LES AMIS DU CHEVALIER D’ÉON ET DU MUSÉE DE TONNERRE | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| LES AMIS DU PATRIMOINE TONNERROIS | Préservation du patrimoine |
| LES GAZOGENES | Sports, activités de plein air |
| LES MEDIEVALES DE TONNERRE | Activités festives (soirées.) |
| LES MERVEILLES DE KHALISSA | échanges locaux, réseaux d'échanges |
| LES PETITS LOUIS DE PASTEUR | Organisation, financement de voyages d'études, d'échanges, pour scolaires ou universitaires |
| LIONS CLUB DE TONNERRE | Associations caritatives, humanitaires, aide au développement, développement du bénévolat |
| LOTUS GROUP | Chant choral, musique |
| LYSOTIS | Centres de loisirs, clubs de loisirs multiples |
| MAISON DES JEUNES ET DE LA CULTURE DU TONNERROIS | Associations socio-éducatives, scoutisme |
| MAISON DES LYCÉENS | éducation formation |
| MINI ENTREPRISE COLLÈGE ABEL MINARD | Associations périscolaires, coopération scolaire, aide à l'enseignement |
| NUITS BLANCHES | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| OFFICE DE TOURISME "LE TONNERROIS EN BOURGOGNE" | |
| ORCHESTRE D'HARMONIE DE LA VILLE DE TONNERRE | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| PIERRES, PÔLE ET COMPAGNIE | Aide à l'emploi, développement local, promotion de solidarités économiques, vie locale |
| PRES HAUTS DÉCOLLAGE | Parents d'élèves |
| PROJETS ARTISTIQUES ET CULTURELS EN TONNERROIS | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| RENAISSANCE DES ORGUES ET MUSIQUE SACRÉE À SAINT-PIERRE DE TONNERRE | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| SOCIETE DE CHASSE COMMUNALE DE TONNERRE | Chasse |
| SOCIETE DE CHASSE DES BOIS COMMUNAUX DE COMMISSEY | Chasse |
| SOCIETE DE CHASSE PLAINE BOIS LA TONNERROISE | Chasse |
| STAR TOYS | Clubs de loisirs, relations |
| TONNERRE CULTURE | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| TONNERRE DÉMOCRATIE TRANSPARENCE | Activités politiques |
| TONNERRE EMPLOI DIGNITE | Comité, défense d'un emploi |
| TONNERRE EN FÊTE | Comités des fêtes |
| TONNERRE FACTORY | Culture, pratiques d'activités artistiques, pratiques culturelles |
| TONNERRE PASSION MECANIQUE | Clubs de loisirs, relations |
| TONNERRE POKER TRICKS | Bridge, jeux de cartes, échecs, dames, jeux de société . |
| TONNERRE SPECTACLES | Promotion de l'art et des artistes |
| TOUS ENSEMBLE | Clubs de loisirs, relations |
| VENT D'EST | Préservation du patrimoine |
| VERSUS KAMPF | Défense des libertés publiques et des droits de l'homme |
| YONNE SPELEO | Escalade, montagne (escalade, spéléologie, via ferrata, canyonisme, alpinisme) |